确定运输合同纠纷的管辖法院的规定是，如果当事人依法约定由原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖的，则按其约定来确定管辖法院；如果无约定的，则管辖法院是被告住所地或者合同履行地的人民法院。法律依据：《中华人民共和国民事诉讼法》第二十三条
因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。
第三十四条
合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。
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